在上一期的著作中,小编主要给人人先容了单细胞微生物基因组测序(Microbe-seq)。现在,要真切了解微生物群落中的菌株水平信息,还是濒临着重大的挑战。若梗概得胜瓦解微生物群落中的菌株水平的高质料基因组【MVSD-048】おしゃぶり天使デビュー 雪乃しずく2007-11-19エムズビデオグループ&$SHOCK150分钟,这将极地面促进咱们对微生物举止过火对宿主的影响的相识。
导语
为突破现存本领短板(a、宏基因组测序:分辩率低,拼装质料差;b、基于培养的法子:只可瓦解一丝数菌株,资本高;c、基于微孔板的单细胞测序:低通量,资本较高),元莘生物引入墨卓生物自主立异以微流控芯片本领和基因检测为中枢的单细胞测序平台——MobiNova-M1。接下来,让咱们侍从小编的相貌,一同恍悟墨卓单细胞测序平台的超强“输出”吧!
MobiNova-M1
MobiNova-M1实测数据展示
收获于该平台的本领上风,单细胞微生物基因组测序平台可骄气多种不同类型微生物样本,包括粪便、唾液、水体、泥土、污泥等不同开端的微生物样本,而且单次实践检测到灵验细胞数富厚>6000个,灵验测序数据占比>50%。其中,临床肠说念微生物表情占比最高,海洋表情为第二大样本类型。通量高,质料好,数据灵验且富厚。
MobiNova-M1实测数据统计
不同开端微生物的样本统计
MobiMicrobe本领旨趣
本显露线
微生物与裂解试剂被包裹到液滴中;
微生物裂解开释出DNA;
在液滴中加入扩增试剂,进行单一微生物基因组扩增;
对扩增的DNA进行片断化解决;
在液滴中加入PCR试剂和带有DNA条形码的微球,进行PCR以标记基因组片断;
突破液滴、辘集带有条形码的DNA片断。
本显露线暗意图
表情周期
常见FAQ
Microbe-seq 可用于什么样本?答:Microbe-seq 可用于各式微生物样本,除了粪便样本之外,还不错检测包括口腔拭子、生殖说念拭子、肠说念本色物、泥土、活性污泥、水体滤膜、海洋千里积物等各种医学、农业、工业及环境微生物样本。
Microbe-seq 能测到若干细胞?测序量若干?答:一个反映的试剂盒至少可测到 6000 个细胞,150G 的数据量。如有需要,且样本量饱和的情况下,可汲取浪掷多个反映考剂盒以达到更高的细胞数。
Microbe-seq 能拼装出若干基因组?拼装质料若何?答:拼装基因组的数目和拼装质料与样本类型、样本中微生物的各样性和拼装法子等多种身分意象,咱们不作保证。一般来说,测到的细胞数目越多,样本中微生物各样性越低【MVSD-048】おしゃぶり天使デビュー 雪乃しずく2007-11-19エムズビデオグループ&$SHOCK150分钟,拼装质料越好。这里给出一个参考依据,发表在 Science 上的 Microbe-seq 本领著作中,7 个样本共 21900 个细胞,系数拼装出 52 个高质料基因组和 24 个中等质料基因组。